台北市长马英九在议会接受质询时相当明确地表示，如果“中央”没有制定有关“公投”的法律并获“立法院”通过，台北市政府不会配合“中央”举办任何形式的“公投”。马英九表示，陈水扁担任台北市长期间，曾配合“一般选举”举办过核四“公民投票”，费用达新台币1600万元。由于没有法律依据，这笔费用的决算直到今天都无法核销。马英九强调，市府若要配合办理“公投”，一定要有法律依据。